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自2003年成立开始，何同火起海盗湾就被全世界版权组织视为眼中钉、肉中刺，被重重围剿。大力推广开放获取的欧盟，何同火起这一比例也仅为12.0%(不计英国则是11.4%)（数据来源：何同火起开放获取：决心与现实——SCI期刊的OA刊比例及国别统计）而在开放获取实际运用过程中，也催生了一些负面影响。

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